Tương tự như vua cha Hor-Aha, Djer được chôn cất ở Umm el-Qa'ab tại Abydos. Ngôi mộ của Djer là mộ O của Petrie. Ngôi mộ của ông còn chôn theo 318 người hầu cùng với ông.[14] Sau này, ngôi mộ của Djer được tôn kính như là lăng mộ của thần Osiris, và toàn bộ phức hợp mai táng của vương triều đầu tiên, trong đó gồm cả ngôi mộ của Djer, trở thành một địa điểm linh thiêng trong tôn giáo truyền thống của người Ai Cập.

Một số đồ vật đã được tìm thấy ở bên trong và xung quanh ngôi mộ của Djer như:[15]

• Một tấm bia đá của Djer, bây giờ nằm ở bảo tàng Cairo có lẽ có nguồn gốc từ Abydos.
• Những tấm thẻ có nhắc đến tên của một cung điện và tên của Meritneith.
• Những mảnh vỡ của hai chiếc bình ghi tên của Nữ hoàng Neithhotep.
• Những chiếc vòng tay của một nữ hoàng được tìm thấy trên bức tường của ngôi mộ.

Trong các ngôi mộ con được khai quật còn tìm thấy:[15]

• Bia đá của một vài người khác.
• Đồ vật bằng ngà voi với tên của Neithhotep.
• Những tấm bảng bằng ngà voi.